Моделирование структуры многокомпонентных материалов: проектное

Моделирование структуры многокомпонентных материалов: проектное обучение

Цели и задачи дисциплины

Целью дисциплины является овладение студентом теоретическими основами метода молекулярной динамики и навыками применения данного метода к получению структур многокомпонентных материалов. В рамках этой цели дисциплина выполняет следующие задачи: 1. Освоение теретических основ метода молекулярно-динамического моделирования и методике его проведения в пакете GROMACS и других вспомогательных программах 2. Построение молекулярно-механических моделей и стартовых систем, необходимых для расчета молекулярной динамики 3. Овладение различными методами молекулярной динамики, с умением настраивать их и управлять ими 4. Анализ траекторий молекулярной динамики и верификация выбранной модели

Краткое содержание дисциплины

В рамках этого курса, составляющего часть проектного обучения "Моделирование структуры и свойств кристаллических и гибридных наноматериалов", студенты научатся самостоятельно выбирать и отлаживать процедуры молекулярного моделирования для воспроизведения структуры и свойств конкретных систем. Дисциплина изучается в рамках программы проектного обучения "Моделирование структуры и свойств кристаллических и гибридных наноматериалов", рассчитанного на 2 года магистратуры. В рамках дисциплины студентам преподаются основные методы работы со структурными файлами и базами данных, построения молекулярно-механических моделей молекул и их систем и, самое главное, различные методы молекулярно-динамического моделирования и их последующая обработка.

Компетенции обучающегося, формируемые в результате освоения дисциплины

Выпускник должен обладать:

ПК-4 Способен к молекулярному моделированию полимеров и биополимеров, их структурных особенностей