Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ №2022610514
Реферат
Программа предназначена для специалистов фармацевтических фирм, исследователей в области разработки лекарственных средств, использующих методы докинга. Программа служит для систематизации результатов, полученных при построении уравнений факторов комплементарности, найденных с помощью карт электронной плотности комплексов рецептор-лиганд, рассчитанных либо с использованием традиционных квантовохимических методов, либо с использованием алгоритма AlteQ. В программе реализованы: методы систематизации оценки качества докинга лигандов к рецепторам (ДНК, РНК, энзимы).
Подробное описание программы
Для моделирования структур комплексов фермент–лиганд существуют различные методы докинга. Часто они позволяют с высокой точностью определить структуры таких комплексов, что подтверждается сопоставлением с данными рентгеноструктурного анализа. Но, тем не менее, методы докинга часто дают набор возможных поз лиганда в кармане рецептора, многие из которых сильно отличаются от найденных экспериментально. Выбор правильной позы лиганда в кармане рецептора является нетривиальной задачей. Поэтому мы создали программное обеспечение, в основе которого лежит предположение о том, что взаимодействие фермента и лиганда является частным случаем взаимодействия субстрат–реагент и подчиняется закону комплементарности их электронных структур. Данное программное обеспечение позволяет определить, насколько комплементарными являются электронные структуры субстрата и реагента в комплексе.
Программа использует PDB файл со структурой комплекса «субстрат–реагент», частным случаем которого может быть комплекс «фермент–лиганд» и название реагента (лиганда), вся остальная часть структуры в PDB рассматривается как субстрат (фермент).
Программа рассчитывает факторы комплементарности электронной структуры.
CF1 был разработан для упрощенного рассмотрения комплементарности в комплексах «фермент–лиганд», проверен на системах с элементами C,N,O,F,P,S,Cl без учёта атомов водорода (рекомендован для рассмотрения комплексов «фермент–лиганд», получаемых методами докинга без атомов водорода).
CF2 является исследовательским.
CF3 был разработан для детального рассмотрения комплементарности, применимого к химически правильным системам (в случае присутствия водородов, они должны быть записаны в PDB файле). CF3 уже был проверен на системах с элементами H,C,N,O,F,Na,Mg,P,S,Cl,K,Ca, Ti,Fe,Zn,Br.
CF4 приблизительно равен CF3 для нековалентно связанных комплексов. Большое отклонение CF4 от СF3 возникает при перекрывании внутренних электронных оболочек, что свидетельствует о возникновении ковалентной связи или некорректной структуре комплекса.
Инструкция и примеры использования программы
Для получения подробной информации и оформления покупки обращаться в патентный отдел:
Адрес: пр. Ленина, 76
Аудитория 321 главного корпуса
Телефон: (351) 267-90-46
E-mail: khafizovaie@susu.ru
И.о. начальник отдела
Хафизова Илона Эдуардовна
Программы
Программа для систематизации результатов расчётов факторов комплементарности по картам электронной плотности.
Программа для прогноза зон контактов лигандов с рецептором по картам электронной плотности
Патенты
Способ получения чугунных мелющих тел
Самокалибрующийся сенсор температуры на ферритовых элементах
Способ диагностирования технического состояния электрических двигателей в режиме реального времени
Способ получения износостойкого покрытия
Криогенный высокоэнтропийный сплав
Схема "Модель эффективности комплексной подготовки спортсменов-скалолазов на начальном этапе"
Способ получения смешанного фотокатализатора на основе оксида титана
Автоматизированный способ определения формальдегида
Способ обеззараживания зерновых культур и других продуктов растительного происхождения
Dear students, postgraduates and teaching staff members of South Ural State University!
My most sincere congratulations to you on the Russian Students Day!
We support and develop the traditions of this wonderful holiday that has deep historical roots. At the same time it always looks ahead to the future since it is namely during student years that we lay the foundations of forming our personality.
South Ural State University has become the winner of a regional grant aimed at creating a new research laboratory. Young scientists, from first-year students to doctors of sciences, will be working there.
Professor of the Institute of Natural Sciences and Mathematics Valery Karachik has built a solution of the Neumann problem in the unit ball. This and other important results in the field of partial differential equations, obtained jointly with Russian and Chinese colleagues, have been published in top-ranking journals and sparked interest among the complex-analysis specialists.
In the Electronics FabLab, creative research teams of students implement their technical ideas under the guidance of experienced mentors – Head of the laboratory N. Gudayev and teachers of the Department of Radio Electronics and Communication Systems.
В Точке кипения ЮУрГУ прошел мастермайнд кафедры иностранных языков по теме «Генеративный ИИ: принципы, этика и стратегии использования в образовательном процессе».
تقليديًا و على نطاق واسع ستحتفل جامعة جنوب الأورال الحكومية بـ "يوم تاتيانا". ماذا يمكننا أن نقول! لجميع الطلاب سيتم بمناسبة الاحتفال تقديم عرضً فلاش- موب مفاجئًا على الجليد، أو عرض فيلم مقتبس عن أحداث تاريخية من القرن الثالث الميلادي، أو مسابقة فيكتورينا، وأكثر من ذلك بكثير.
ومع ذلك، فإن الأهم من ذلك كله هو أن الطلاب سيكونون سعداء بـ "الهدية الترويجية" التي طال انتظارها والتي يحبونها كثيرًا: سيتم ضيافة طلاب العلم الجائعين بطبق الطلاب المفضل لديهم. أي طبق؟ حاول التخمين بنفسك! هذا صحيح، سيتم تقديم الفطائر والنبيذ الساخن والشاي والقهوة لجميع الطلاب!
